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《济宁医学院学报》杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀期刊，济宁医学院学报杂志具有正规的双刊号，其中国内统一刊号：CN37-1143/R，国际刊号：ISSN1000-9760。济宁医学院学报杂志社由山东省教育厅主管、济宁医学院主办，本刊为刊。自创刊以来，被公认誉为具有业内影响力的杂志之一。济宁医学院学报并获中国优秀期刊奖，现中国期刊网数据库全文收录期刊。
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《济宁医学院学报》坚持“四项基本原则”，坚持改革开放，坚持为社会主义精神文明建设和物质文明建设服务的宗旨，促进医学教育发展和医学科研进步，发现和培养青年科技工作者。《济宁医学院学报》创刊于1978年。是由国家出版署批准，山东省教育厅主管，由济宁医学院主办的国内外公开发行的学术性期刊。国内统一刊号：CN37-1143/R。国际标准连续出版物号：ISSN1000-9760，国内外公开发行。1990年加入美国期刊检索机器识读系统(CODEN)，代码为JYXUE6；同时纳入中国学术期刊光盘版。《济宁医学院学报》是万方数据-数字化期刊源期刊，中国学术期刊网期刊，中国学术期刊评价数据库源期刊，中国生物医学期刊数据库源期刊，中国核心期刊（遴选）数据库期刊等多个数据库收录期刊。2009年1月，经山东省新闻出版局批准，《济宁医学院学报》刊期由季刊改为双月刊。
办刊宗旨：
（一）《济宁医学院学报》是经国家科技部批准的全国性学术期刊，用以宣传党的医学教育方针，反映我院及其附属医院、教学医院、实习医院和各级医疗科研单位在医学教育、医药卫生、科学技术研究等方面所取得的成就；是收集、存储、传递学术信息的固定载体，是发现和培育科技人才的园地，是社会整体科学能力的组成部分。
（二）学报必坚持党的四项基本原则，贯彻党的“百花齐放、百家争鸣”的方针，坚持为社会主义经济建设服务，为促进科学文化事业的繁荣，建设社会主义物质文明和精神文明服务。

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