基于16SrDNA和看家基因序列分析技术的鲍鱼养殖水体弧菌种类的鉴

本文作者：龚婷；骆祝华；于艳萍；JOSTGunter；成功正常投稿发表论文到《应用海洋学学报》2014年04期,引用请注明来源400期刊网！

【摘要】：采用TCBS选择性培养基从厦门某鲍鱼养殖场的养殖水体中分离到19株细菌.经16SrDNA序列分析,所有菌株均属于弧菌属(Vibrio),且与最近似的弧菌模式种的同源性都在98.99%以上.由于弧菌种间16SrDNA序列相似度极高,无法仅靠16SrDNA序列比对来鉴定这些菌株到种的水平.16SrDNA序列的系统发育分析也显示,大多数菌株与弧菌模式种无法归为一簇,表明16SrDNA基因在弧菌种的分类鉴定上分辨率不高.进一步采用基于4种看家基因(rpoA、pyrH、gapA和topA)的多位点序列分析技术(MLSA)对分离到的弧菌菌株进行分类鉴定,结果显示19株海洋弧菌归于溶藻弧菌(Vibrioalginalyticus)与魔鬼弧菌(Vibriodiabolicus)2个种,表明这两种弧菌是该鲍鱼养殖场水体环境中的优势弧菌种,在鲍鱼养殖弧菌病害防治方面需要重点关注.此外,看家基因与16SrDNA基因的多态性分析表明,4种看家基因的多态位点比率均高于16SrDNA.4种看家基因串联后的多态位点比率高达41.1%,远高于16SrDNA基因的13.4%,表明看家基因相较于16SrDNA基因有着更高的分辨率,更适合于海洋弧菌的分类鉴定.
【论文正文预览】：(1.国家海洋局第三海洋研究所、国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,福建厦门361005;2.德国莱布尼兹波罗的海研究所,德国罗斯托克D18119)弧菌是海洋环境中常见的细菌类群之一,广泛分布于近岸与河口海区的水体与生物体中,是海水养殖动物最主要的病原菌之一.弧菌科属于革兰氏
【文章分类号】：S944.4
【稿件关键词】：海洋生物学鲍鱼海洋弧菌SrDNA看家基因多位点序列分析
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【稿件标题】：基于16SrDNA和看家基因序列分析技术的鲍鱼养殖水体弧菌种类的鉴定
【作者单位】：国家海洋局第三海洋研究所、国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室;德国莱布尼兹波罗的海研究所;
【发表期刊期数】：《应用海洋学学报》2014年04期
【期刊简介】：《应用海洋学学报》杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀期刊，应用海洋学学报杂志具有正规的双刊号，其中国内统一刊号：CN35-1319/P，国际刊号：ISSN2095-4972。应用海洋学学报杂志社由国家海洋局主管、主办，本刊为季刊。自创刊以来......更多应用海洋学学报信息
【版权所有人】：龚婷；骆祝华；于艳萍；JOSTGunter；

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