本文作者：贾美多；杨闫；张盈盈；李春；成功正常投稿发表论文到《浙江农业学报》2014年06期,引用请注明来源400期刊网！

【摘要】：基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
【论文正文预览】：生物序列分析是生物信息学的主要研究领域,常常通过比较分析获取有用的信息。传统的序列比较方法是序列比对[1-2],但是利用比对的序列比较假设了同源片段之间是邻接保守的,这和遗传重组相冲突,而且多序列比对在计算复杂性等方面存在困难,这些使得人们致力于研究无比对的序列比
【文章分类号】：Q51
【稿件关键词】：-字母分类模型维向量系统发生分析
【参考文献】:

• 贾晓超,李培芳,罗辽复;基因组中“k字”频数的分布[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2005年03期
• 沈娟;吴文武;解小莉;郭满才;袁志发;;基于DNA序列K-tuple分布的一种非序列比对分析[J];遗传;2010年06期
• 刘俊宏;李春;;DNA序列基于k-字的数值刻画及其应用[J];生物信息学;2013年02期
• 张盈盈;李春;杨闫;贾美多;;基于多重集逆序数的DNA序列的数值刻画及其应用[J];计算机与应用化学;2014年06期
• 周扬;屈武斌;卢一鸣;张成岗;杨毅;;基于文本频谱的中文文本聚类方法[J];四川大学学报(自然科学版);2012年06期
• 沈娟;吴文武;解小莉;郭满才;袁志发;;基于DNA序列K-tuple分布的一种非序列比对分析[J];遗传;2010年06期
• 刘俊宏;李春;;DNA序列基于k-字的数值刻画及其应用[J];生物信息学;2013年02期
• 解小莉;生物序列的分析方法及其进化模型研究[D];西北农林科技大学;2012年
• 梁丽萍;DNA序列选择进化距离及其在系统发育分析中的应用[D];西北农林科技大学;2011年
• 詹青;基于信息熵理论的基因组特性研究[D];哈尔滨工业大学;2011年
• 沈娟;新对称相对熵与DNA序列相似性分析[D];西北农林科技大学;2010年
• 李丹;基于蛋白质图形表示的膜蛋白跨膜区预测[D];浙江理工大学;2013年
• 刘倩;数学模型在生物序列结构比较中的研究及其应用[D];燕山大学;2013年
• 耿长春;蛋白质序列空间曲线构造及相似性分析[D];浙江理工大学;2014年
• 刘玉新;基于迭代函数的生物序列图形表示及其应用[D];浙江理工大学;2014年
• 刘军,许甫荣;基于相对熵原理构建生物进化系统树[J];北京大学学报(自然科学版);2003年S1期
• ;LZ Complexity Distance of DNA Sequences and Its Application in Phylogenetic Tree Reconstruction[J];Genomics Proteomics & Bioinformatics;2005年04期
• 罗辽复;DNA序列信息内容的普适关系[J];合肥学院学报(自然科学版);2005年01期
• 万全;郑将臣;程起群;赵金良;;基于12SrRNA序列研究龟鳖类的系统进化特征[J];海洋渔业;2010年03期
• 何静;周婷;饶定齐;张亚平;;云南闭壳龟(Cuora yunnanensis)的分子鉴定及进化地位研究[J];科学通报;2007年17期
• 罗辽复,纪丰民,谢立青,李弘谦;以核苷酸短程关联为基础的进化树重建(英文)[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2001年01期
• 贾晓超,李培芳,罗辽复;基因组中“k字”频数的分布[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2005年03期
• 李菁;李逢博;王炜;;蛋白质序列复杂性简化与非比对序列分析[J];生物化学与生物物理进展;2006年12期
• 骆嘉伟;张惜珍;;一种新的基于3D图形的进化树构造方法[J];武汉理工大学学报(信息与管理工程版);2007年04期
• 李斌;李义兵;何红波;;符号序列间的LZ复杂性距离及其应用[J];小型微型计算机系统;2007年05期
• 黄敏,沈晖,肖奕*;不同结构类蛋白质序列中的关联特性[J];生物物理学报;2000年04期
• 王发生,罗敏;在网络上作蛋白质序列分析[J];生命的化学;2001年01期
• 管维红;张立婷;徐振源;朱平;;蛋白质序列混沌特性的研究[J];生物信息学;2008年04期
• 管维红;徐振源;朱平;;用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅰ)[J];食品与生物技术学报;2008年01期
• 肖绚;邵世煌;;一种新颖的蛋白质序列可视化模型[J];计算机工程;2008年03期
• 管维红;徐振源;朱平;;用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅱ)[J];食品与生物技术学报;2008年02期
• 马影;于晓庆;周杨;杨柳;李春;;蛋白质序列的一类新的二维图形表示及其应用[J];宜春学院学报;2008年04期
• 李丹丹;王俊;李春;;蛋白质序列的一种新的三维图形表示及其应用[J];生物信息学;2009年01期
• 汤丽华;;基于小波分析的蛋白质序列分形研究[J];科技信息;2009年33期
• 肖前军;周金玉;邓总纲;;蛋白质序列混沌游戏表示模拟效果的优化[J];汕头大学学报(自然科学版);2010年01期
• 光宣敏;郭延芝;李梦龙;汪夏;;支持向量机预测蛋白质序列中胱氨酸氧化还原态[A];第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2009年
• 李通化;孙江明;李大鹏;唐胜男;丛培盛;;从蛋白质序列到结构和功能[A];第十一届全国计算（机）化学学术会议论文摘要集[C];2011年
• 肖奕;;蛋白质序列的对称性[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
• 陈文理;庞小峰;;LC／MS技术在蛋白质序列检测上的应用[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
• 荐文;专利保护什么[N];医药经济报;2001年
• 徐海松;蛋白质序列中的折叠和去折叠信息[D];北京工业大学;2011年
• 林卫中;蛋白质序列离散灰色模型及其在药物开发中的应用研究[D];东华大学;2013年
• 吴自凯;信息度量的蛋白质序列、结构、质谱数据研究[D];大连理工大学;2007年
• 王栋;蛋白质序列的并行分类方法研究[D];天津大学;2010年
• 李明锋;结构对称蛋白质性质研究[D];华中科技大学;2008年
• 杨凡;生物序列分析中若干问题的研究[D];电子科技大学;2011年
• 王彤;高维生物数据的分类与预测研究[D];上海交通大学;2009年
• 刘亮伟;木聚糖酶蛋白质序列分析、分子进化和分子模拟[D];江南大学;2005年
• 余宏杰;生物序列特征信息提取方法及其应用[D];中国科学技术大学;2013年
• 席莉莉;计算机辅助药物和蛋白性质预测研究[D];兰州大学;2010年
• 张艳萍;蛋白质序列的数学描述及其应用[D];浙江理工大学;2010年
• 李明锋;蛋白质序列和结构关系研究[D];华中科技大学;2005年
• 张堃;基于粒度下的蛋白质序列的分析[D];江南大学;2011年
• 钱盼盼;蛋白质序列新的表示方法[D];山东大学;2011年
• 孔芬;蛋白质序列相似性分析的几种数学方法[D];浙江理工大学;2013年
• 张羊;基于谱的蛋白质序列比对方法研究[D];西安电子科技大学;2009年
• 贺晓梅;蛋白质序列特征表达及其在亚细胞定位预测中的应用[D];湖南大学;2012年
• 周大为;蛋白质序列模式在细菌基因发现中的应用[D];江南大学;2013年
• 廖本友;蛋白质序列图形表达方法及应用研究[D];湖南大学;2011年
• 张玲;流感大爆发多重预警的统计模型[D];江南大学;2014年

【稿件标题】：【红桃k蛋白质粉】蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
【作者单位】：渤海大学数理学院;
【发表期刊期数】：《浙江农业学报》2014年06期
【期刊简介】：《浙江农业学报》杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀期刊，浙江农业学报杂志具有正规的双刊号，其中国内统一刊号：CN33-1151/S，国际刊号：ISSN1004-1524。浙江农业学报杂志社由浙江省农业科学院主管、主办，本刊为刊。自创刊以来，......更多浙江农业学报杂志社(http://www.400qikan.com/qk/6050/)投稿信息
【版权所有人】：贾美多；杨闫；张盈盈；李春；

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